Lactobacillen behoren net als de bifidusbacteriën tot de melkzuurbacteriën en maken deel uit van de darmflora van het menselijk lichaam. Ze behoren tot de eerste bacteriën die de kinderdarm koloniseren en zijn ook in latere levensfasen een van de meest voorkomende soorten bacteriën in de darm. Lactobacillen zijn ook aanwezig in de moedermelk. Lactobacillus fermentum bijvoorbeeld is de op een na vaakst voorkomende lactobacil in de moedermelk. De melkzuurbacteriën van de moedermelk helpen om een gezonde darmflora op te bouwen en ondersteunen het immuunsysteem van het kind.